s15シルビアですが車検と同時に構造変更を5ナンバーから3ナンバーに、ATからMTに、最低地上高を変えるとどれぐらいの費用かかりますか？

Answer 1

ショップ次第ですね。

この3点で事前審査が必要なのはMT化だけです。
こちらは5～10万円です。
慣れたショップなら数値を入力すると計算されるような雛型を作成しています。
何度も申請している内容なら半日で書類作成出来ます。

最低地上高の変更(90mm以下50mm以上)はアンダーカバーで処理することになり、MT化の部分が隠れてしまいますので同時には難しいと思います。
90mm以上であるならノーマルと同じ構造で構わないので、そちらで諦めることをお薦めします。

全幅の変更はリアフェンダーをカットしているなら、その切断面の処理が重要です。
切断面を溶接していないのなら、歪み検査が必要となり、別途30万円程必要です。
溶接しているのならMT化のおまけでやってくれるかもしれません。

うちならフェンダー切断面が溶接されている、最低地上高90mm以上という条件で、書類作成、申請代が10万円です。

車検の費用は別途必要です。
こちらは7万円～で手直しが必要かどうか車両を見ないと判断できません。

Answer 2

50万あればたりる

Answer 3

自分はAW11のフェンダー切って溶接してもらってからFRPのバーフェンビス留めしてもらったけど記載変更だけで10万余計にかかったくらいかな。

あとレビンやセリカなんかの6速ミッション載せ換えの見積りを取ってもらった時は70万でした。

車は違うけど参考までに。

地上高は変わっても費用はかからない。

車高調やバネの交換だけなら自分で出来るので工賃は分かりませんね。