ミラココアのスマートキーと普通のさす鍵の違いを教えてください。車のグレードが関係あるのでしょうか？

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質問の意図がちょっと解らないのですが、キーレスエントリー車とキーフリー車の機能の違い…というよりは、キーレス車とキーフリー車に別れているが、その別れている理由がグレード差に因るものか？ということでしょうか？

機能はたぶんご存じかと思いますが、キーを挿してエンジンかけるか、リモコン持った状態でノブ捻ればかかるかの違いです。
(ドアにボタンがあるからリモコン取り出さなくてもロック解除出来るのもそうですね)
あと、キーフリー車にはイモビライザー(盗難防止装置)も装備されるようです。

で、そのキーフリーが付いてるココアと付いてないココアの違いですが、ご推察通りグレードの差に因るものです。
下のグレードであるL(プラスL)はキーレス、真ん中のX(プラスX)以上はキーフリーです。
両者はメーターが違ったり、ミッションがATかCVTかで差があったり(前期型のみ)、2トーン塗装が選べなかったり、マニュアルエアコンとオートエアコンの違いがあったようです。(細かい部分も入れればもっと差はある)

そんなわけで、下のグレードは最低限求められる機能を、真ん中以上のグレードからは有ると便利だなと思う機能を追加という感じで差がつけられていて、そこにキーフリーも入っていたと言うことですね。