日産k13マーチのエンジン型式HR12DEのDEとはなんですか？ 部品など適合表とかにはDEの文字がありますが車検証にはDEの文字がありません。これでも適合しますか？

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日産のエンジン型式は数字が排気量。これに続く「D」は「DOHC」を示し、「E」は「エレクトリックフェールインジェクション(EFI)」を意味します。
なのでHR12DEは「HR型 1.2L DOHC EFI仕様」という意味です。

なおHR12には「HR12DDR」も有り、これは「HR型 1.2L DOHC 直噴 スーパーチャージャー付」になります。

車検証上のエンジン型式については、メーカーの型式認証によるので何とも言えませんが、純正部品について「HR12」と書かれていればHR12DE・HR12DDR共通の部品のはずです。社外品については部品ごとに調べて適合するかを調べる必要があります。

ただしHR12DDRは国内ではE12型ノートのみに採用されたことがあるだけですから、HR12用と書かれているパーツは基本的にHE12DE用と考えて良いと思いますけど。