トヨタのGRとは、GRヤリスのように頭につくときとそうでない時がありますが、どういった違いで分けているのでしょうか？

Answer 1

ざっくりですし今後また変わると思いますけど、今はこんな感じでは？

GRXXXX：ブランド専用車両。現状「GRスープラ」「GRヤリス」「GR86」が存在する。逆に「ノーマルスープラ」「ノーマル８６」が存在しない。
※「ノーマルヤリス」はあるけど、ボディシェルからエンジン駆動方式に至るまで別車種。

XXXX GRMN：スポーツチューンドカー。MN=Meister of Nürburgring。

XXXX GRスポーツ：GRパーツを組み込んだドレスアップカー。

質問者からのお礼コメント

お二人、回答ありがとうございます!

Answer 2

トヨタのgrブランドの格付けらしいです。トヨタのスポーツカーブランドとしてGRの名を冠してGRMN→GR→GRスポーツ→GRpartsのピラミッド構造としたとWikipediaにあります。
GRMNは限定〇〇台の時に使う様です。
個人的にはGR独自のパーツを付けたもの又は特別な車種がGRで、それ以外が通常のものと理解してます。