車種は同じでNAにターボ用のマフラーは構造的にはつくのですか？

Answer 1

車種等による。
また取り回しは同じでもパイプ径の違いからフランジの大きさが異なり、不可能では無いとしても難しい場合もある。

車種による部分では、NAとターボで取り回しが異なる場合や接続箇所の違いにより不可能な場合もあります。
例えばですが古い車種で知り得る物としては、トヨタのセリカ。
NAはFFのみ、ターボは4WDと言った違いにより燃料タンクの位置も異なる事から排気の取り回しも異なる。
次にパイプ径の違いの場合、接続箇所や長さに取り回しは同じでもパイプ径が異なる事でフランジの大きさが異なり、ネジ穴が合わない部分でNAのフランジの長穴加工で対応出来る場合もあるが、フランジの大きさが異なる事で排気漏れを起こすくらいのギリギリの場合もある。
この場合にはターボ側のフランジをNAにも使える様に、フランジを合う物へ変更しながら異径パイプ等へ部分的に変更して合わせる必要もある。

実例としては、フランジの角度が異なった場合もあった。

Answer 2

物理的には付くでしょうが、NA用とターボ用のマフラーは排圧の関係で系が違うので、低速トルクは細くなり、燃費も落ちるし、パワーも下がるなどなどで、「百害あって一利なし」ですので止めるべきですね。

Answer 3

中間より後ろなら付くかもしれん物もある。けど大抵はメインパイプの径やら取り回しが違ったりで互換性は無い。