H15年式 ワゴンR（TA-MC22S RR：K6A／AT／FF）で、AT→MT載せ換えを計画しております。 H13年式 スズキKei（GF-HN11S：F6A／5MT／4WD）をもらったので、ミッションを流用したいのですが互換性ありますか？

Answer 1

あなたのワゴンR RRはコラムATですか？ フロアATですか？
まず解決するにはここからです。
フロアATなら第一段階クリアー
コラムATだったら、ペダル式パーキングブレーキからフロア式パーキングブレーキに変更。それに伴い、ベンチシートも取り外し、セパレートシートに交換。 ペダル式パーキングブレーキの場所がクラッチペダルになります。
次は、4WDのミッションの構造について。 FFベースの4WDミッションはFF車のミッションと基本的に構造が違い、リヤデフに駆動を伝える「センターデフ」がミッションに組み込まれていて、ミッション本体の形状が後ろに張り出す形になってます。
その「後ろの張り出し」を交わすようにKeiのボディーが凹んでるはずです。
あなたのRRにその凹みと言うか、ミッションの出っ張りをクリアーできるスペースが有るなら「使える」ですが、車の下をジャッキアップして確認してみて下さい。
まずKeiのミッションとプロペラシャフトの接合部分。
次にあなたのRRのミッション。
Keiのミッションとプロペラシャフトの接合部分が来ると思われるRRのボディー部分にKeiと同じような「逃げスペース」が有れば使えますが、無いなら「無理」です。
私はアルトワークスのFF（RS/X）と4WD（RS/R)を所有してましたが、ミッション形状の違いでフロアー形状も違い、それに伴いシフトノブの位置と高さが全く違いました。
FFはシフト～ミッションがロッド式
4WDはシフト～ミッションがワイヤー式でシフトフィーリングも違います。

質問者からのお礼コメント

とても参考になりました。どうもありがとうございました。