ダイハツオプティビークスのターボモデルなのですが、ボンネットに穴が開いてないモデルってあるのでしょうか？ ご回答お待ちしております。

Answer 1

ない、はず。

逆にターボなし（NA）の穴開きボンネットはあります。
ボンネットを共用してたんですね。

Answer 2

改造していれば別ですが基本はないと思います。あそこからインタークーラーに空気を取り込んでいます。穴がなければ冷えが悪くなり性能が落ちます。改造しているやつなら別の場所にインタークーラーをつけて冷やしているものもあります。