同じ年式のダイハツミラとトヨタのピクシスエポックではどちらが燃費がよいでしょうか？またどちらが純正部品もまだ残ってますか？

Answer 1

先ず、ミラとミライースとでは違う車種になります。

ミラの最終モデル(型式･L275/L285)の販売時期は2006年12月～2018年3月。
※2014年辺りから乗用モデルを廃止し商用モデルのみ販売

ミライース(初代･LA300S/LA310S)のは2011年9月～2017年5月。

エンジン性能や燃費性能は後発のミライースが良いです。

で、本家がミライースで、トヨタにOEM供給しているのがピクシスエポック。
エンブレムが違うだけで中身は全く同じです。

なので質問の回答はピクシスエポック(＝ミライース)です。

メンテナンスに関する部品に関しては心配いりません。