新型Sクラスのハイブリッドが搭載したエンジンですが、

Question

何故V6じゃなくて直6だったのでしょうか？

Answer 1

V6の最大のメリットはエンジン長を縮められる点でした。
エンジン長が長いとクランクシャフトの捻れ負荷が大きく強度や製造精度が必要となります。
V6化する事でエンジン長が短くなりまずが、付帯部品は増えて横に広がります。
従来の構成ではそれでも良かったのですが、補助駆動モーターや回生発電容量確保といったマイルドハイブリッドを構成する部品を配置するのに更に横方向にスペースが必要となります。
そこで、クランクシャフト長を伸ばさずに直列で6気筒並べる事で課題を解決しています。
BMWのように6気筒を直列に拘ってきたのではありませんが、結果として20年の歳月を経て直6に回帰した事になります。

直列6気筒は、慣性振動も偶力振動も原理的に発生しません。
V6では、この振動を回避できません。
V12にでもすれば、直列6気筒と同様に振動が発生しないのですけど。
振動にも有利なので、クランクシャフトにコストをかけても経済的に釣り合うのでしょう。

Answer 2

直6は直4の製造ラインで製造出来るから。

V6は直4と混合生産には対応しません。