エブリィなどの4ナンバー軽貨物とjb23ジムニーの4ナンバー軽貨登録車の場合、維持費等はそこまで差はないでしょうか？

Answer 1

年式が同じであれば維持費は変わりません。。。
JB23Wは年式が古ければそれなりに維持費がかかりますが、改造してなければ気にするほど高くなることはありません。

Answer 2

ジムニーはタイヤが重い、減速ギアの数が多いなどの理由で燃費が悪いです。
普段乗りしていれば車検代より任意保険よりガソリン代が高くなると思いますので、ここの差は大きいです。